Ominaisuudet genotyyppi, reaktiostandardi, määritys

Hän genotyyppi Se on määritelty geenisarjaksi (heidän alleeleillaan), jotka he koodaavat tietylle ominaisuudelle tai ominaispiirteelle, jotka erottuvat muista tietyllä funktiolla tai sekvenssillä. Jotkut kirjoittajat kuitenkin määrittelevät sen myös genomin osana, joka aiheuttaa fenotyypin tai organismin alleelisen perustuslain.

Vaikka termit genotyyppi ja fenotyyppi eivät liity siihen, ne eivät ole sama asia. Tässä mielessä fenotyyppi määritellään organismin näkyvien ominaisuuksien joukkoksi, jotka ovat seurausta sen geenien ilmentymisestä, ja genotyypiksi geenisarjana, joka johtaa tiettyyn fenotyyppiin.

Genotyyppi ja fenotyyppi (lähde: Kansallinen ihmisen genomien tutkimuslaitos [julkinen alue] Wikimedia Commonsin kautta) Genotyyppi on vain yksi fenotyypin perustamiseen liittyvät tekijä nukleotidisekvenssiä muovaa myös yksilöiden näkyviä ominaisuuksia.

Siten kahdella organismilla on sama genotyyppi, jos niillä on samat geenisarjat, mutta sama ei ole totta kahdelle organismille, joilla ilmeisesti on sama fenotyyppi, koska samanlaiset ominaisuudet voivat olla eri geenien tuote.

Se oli tanskalainen kasvitieteilijä Wilhelm Johansen vuonna 1909, joka esitteli ensin tieteen termejä genotyyppi ja fenotyyppi, hänen nimeltään "Tarkasta perinnöstä koskevan teorian elementit ", joka oli koesarjan tuote, joka suoritti ohran ja herneiden puhtaiden linjojen ylittämisen.

Hänen teoksensa, jotka todennäköisesti inspiroivat muutamaa vuotta aikaisemmin Gregorio Mendelin tekemiä, pidetään "Genetiikan isä”, Antoi hänelle selventää, että organismin genotyyppi aiheuttaa fenotyypin erilaisten kehitysprosessien ja ympäristön vaikutuksen kautta.

[TOC]

Ominaisuudet

Genotyyppi ei ole täsmälleen sama kuin genomi. Tässä on ero molempien käsitteiden välillä:

- "Genomi" viittaa kaikkiin geeneihin, jotka yksilö on perinnyt vanhemmiltaan ja kuinka ne jakautuvat ytimen kromosomeihin.

- "Genotyyppi" on termi, jota käytetään esimerkiksi geenisarjaan ja niiden variantteihin, jotka aiheuttavat tietyn piirteen, että yksilö erotetaan populaatiossa tai lajissa.

Vaikka genotyyppi on alttiita muutoksille mutaatioista koko organismin elintärkeän historian ajan, genotyyppi on yksilöiden suhteellisen muuttumaton piirre, koska teoriassa perinnölliset geenit ovat samat raskaudesta kuolemaan.

Luonnollisessa populaatiossa tietyn genotyypin muodostavilla alleeleilla on erilaiset ulkonäön taajuudet; Toisin sanoen jotkut esiintyvät populaatioissa enemmän kuin toisissa, ja tämä liittyy joidenkin asioiden välillä jakautumisessa, ympäristöolosuhteissa, muiden lajien läsnäolossa jne.

Termi "genotyyppi villi”Määrittää ensimmäisen luonteen löydetyn alleelivariantin, mutta ei välttämättä viittaa alleeliin, jota löytyy useammin väestöstä; ja termi "genotyyppi Mutantti”Sitä käytetään tällä hetkellä määrittelemään ne alleelit, jotka ovat erilaisia ​​kuin villit.

Genotyypin kirjoittamiseksi käytetään yleensä isoja kirjaimia ja pieniä kirjaimia. Löityjä kirjaimia käytetään määrittelemään hallitsevat ja pienet alleelit syvennyksiin.

Genotyyppireaktiosääntö

Yksilöt perivät vanhempiensa geenit, mutta eivät lopputuotteita, jotka saadaan heidän ilmaisustaan, koska ne ovat riippuvaisia ​​monista ulkoisista tekijöistä ja heidän kehityksen historiasta.

Tämän mukaan ja viittaa vain ympäristötekijöihin, genotyyppi voi johtaa useampaan kuin yhteen fenotyyppiin. Sarja mahdolliset "tulokset" spesifisen genotyypin vuorovaikutuksesta eri ympäristöissä on mitä tutkijat ovat kutsuneet "genotyyppireaktiosääntöksi".

Genotyypin reaktio -normi on silloin eräänlainen "kvantifiointi" tai rekisteröinti genotyypin vuorovaikutuksista saatujen näkyvien ominaisuuksien kanssa tietyissä ympäristöissä. Se voidaan ilmaista grafiikoina tai taulukoina, jotka "ennustavat" mahdolliset tulokset.

Tietenkin on selvää, että reaktiostandardi viittaa vain osittaiseen genotyyppiin, osittaiseen fenotyyppiin ja muutamiin ympäristötekijöihin, koska käytännössä on erittäin vaikea ennustaa ehdottomasti kaikkia vuorovaikutuksia ja kaikkia näiden tuloksia.

Kuinka genotyyppi määritetään?

Määritä genotyyppi tai "genotipifio" samojen lajien yksilöiden organismin tai populaatio tarjoaa paljon arvokasta tietoa sen evoluutiobiologiasta, populaatiobiologiasta, taksonomiasta, sen ekologiasta ja geneettisestä monimuotoisuudesta.

Mikro -organismeissa, kuten bakteereissa ja hiivoissa, koska niillä on korkeampi kertolasku- ja mutaatioaste kuin useimmilla monisoluisilla organismeilla, genotyypin määrittäminen ja tunteminen mahdollistaa kokoelmien siirtokuntien identiteetin hallintaa, samoin kuin joitain epidemiologian, ekologian ja taksonomian ominaisuuksia samasta.

Genotyypin määrittämiseksi on tarpeen saada näytteitä organismista, jolla haluat työskennellä, ja tarvittavat näytteet riippuvat jokaisesta organismista. Esimerkiksi eläimissä voidaan ottaa näytteitä eri kudoksista: häntä, korvat, ulosteet, hiukset tai veri.

Organismin genotyyppi voidaan määrittää kokeellisesti joidenkin nykyaikaisten tekniikoiden käytön ansiosta, mikä riippuu geenien genomisesta sijainnista opiskeluun, budjetista ja ajasta, käytön helppoudesta ja halutun suorituskyvyn asteesta.

Tällä hetkellä organismin genotipifiointiin käytettyihin tekniikoihin sisältyy hyvin usein molekyylimarkkerien käyttö ja analysointi DNA: n ja muiden edistyneempien tekniikoiden polymorfismien havaitsemiseksi, jotka tarkoittavat genomisekvensointia.

Lisää työntekijöiden merkkejä

Eniten käytettyjä merkkejä löydämme seuraavat:

- RFLP: t (restriktiofragmenttien polymorfismit).

- AFLP: t (monistetut fragmenttien pituudet polymorfismit).

- Rapdit (satunnaisesti monistettu polymorfinen DNA).

- Mikrosatelliitit tai SSR: t (toistuva yksinkertainen sekvenssi).

- ASAPS (alukkeet, jotka liittyvät tiettyihin alleeleihin).

- SNP: t (yksinkertaiset nukleotidipolymorfismit).

Tekniikat, jotka käyttävät sekvensointia ja hybridisaatiota

Ja tekniikoiden joukossa, jotka käyttävät spesifisten koettimien spesifistä sekvensointia ja hybridisaatiota, ovat:

- Sekvensointi Sangerin menetelmällä.

- Korkean suorituskyvyn genotipifiointi.

- Harjoittelu "Kultainen portti”Illuminasta.

- Genotipifiointi (GBS).

- Taqman -essee.

- Uuden sukupolven sekvensointi.

- Mikrolaite.

- Täysi genomisekvensointi.

Viitteet

1. Griffiths, a., Wessler, S., Lewontin, R., Gelbart, W., Suzuki, D., & Miller, J. (2005). Johdatus geenianalyysiin (8. ed.-A. Freeman, W. H. & Yhtiö.
2. Klug, W., Cummings, m., & Spencer, c. (2006). Genetiikan käsitteet (8. ed.-A. New Jersey: Pearson Education.
3. Kwok, P.-JA. (2001). Menetelmät genotyyppien yhdistämiseksi. Annu. Rev. Genomiikka hum. Genetti., 2(11), 235-258.
4. Mahner, m., & Kary, M. (1997). Mitä tarkalleen ovat genomit, genotyypit ja fenotyypit? Ja entä ilmiöt ? J -. Teoria. Bioli., 186, 55-63.
5. Mueller, u. G., & Wolfenbarger, L. Lens. (1999). AFLP -genotyyppi ja sormenjälki. Puu, 14(10), 389-394.
6. Kansallinen terveysinstituutti. Haettu 14. toukokuuta 2019, www.NIH.Gov/
7. Patel, D. -Lla., Zander, m., Dalton-Morgan, J., & Batley, J. (2015). Edistykset kasvien genotyyppien määrittämisessä: missä tulevaisuus vie meidät. J: ssä. Batley (Ed.-A, Kasvien genotyyppi: menetelmät ja protokollat (Vol. 1245, s. 1-11). New York: Springer Science + Business Media, New York.
8. Pierce, b. (2012). Genetiikka: käsitteellinen lähestymistapa. Freeman, W. H. & Yhtiö.
9. Schleif, r. (1993). Biologian genetiikka ja molekyyli (2. painos.-A. Maryland: Johns Hopkins University Press.
10. Tümmler, b. (2014). Genotyyppimenetelmät. Jonkin sisällä. Filloux & J. Lens. Ramos (toim.-A, Menetelmät molekyylibiologiassa (Vol. 1149, s. 33-47). New York.
11. Yang, W., Kang, x., Yang, Q., Lin ja., & Fang, m. (2013). Katsaus genotyyppimenetelmien kehittämiseen maatilan eläinten monimuotoisuuden arvioimiseksi. Eläintieteiden ja biotekniikan lehti, 4(2), 2-6.