SSB -proteiinien ominaisuudet, rakenne ja toiminnot

Se SSB -proteiinit o DNA: ta sitovat proteiinit yksinkertainen nauha (englannista "sniellä-sTrand -DNA b -Inding proteiinit ”), Ne ovat proteiineja, jotka ovat vastuussa stabiloinnista, suojaamisesta ja väliaikaisesti ylläpitämisestä.

Organismin geneettinen informaatio on suojattu ja koodattu kaksinaista DNA: lla. Jotta tämä voidaan kääntää ja toistaa, on välttämätöntä, että se rentoutuu ja työttömyys, ja juuri siinä prosessissa SSB -proteiinit osallistuvat.

32 KDA -fragmentti (RPA32) replikaatioproteiinin alayksikön (lähde: Jawahar Swaminathan ja MSD: n henkilökunta Euroopan bioinformatiikan instituutissa [julkinen alue] Wikimedia Commonsin kautta Wikimedia)

Nämä proteiinit kypsennetään yhteistyössä muiden erilaisten monomeerien kanssa, jotka osallistuvat heidän DNA: nsa stabilointiin ja joita esiintyy sekä prokaryooteissa että eukaryooteissa.

SSB -proteiinit Escherichia coli (ECSSB) olivat ensimmäiset tämän tyyppiset proteiinit. Näille oli ominaista funktionaalisesti ja rakenteellisesti, ja niiden löytämisen jälkeen niitä on käytetty tällaisen proteiinin tutkimusmallina.

Eukaryoottisten organismien proteiinilla on samanlainen kuin bakteerien SSB -proteiinit, mutta eukaryooteissa nämä tunnetaan RPA -proteiinina tai replikaatioproteiineina A (englannista Proteiinin replikaatio A) että ne ovat toiminnallisesti samanlaisia ​​kuin SSB.

Löytöjensä jälkeen on käytetty laskennallisia biokemiallisia funktionaalisia malleja SSB-proteiinien ja yksinkertaisen ketjun DNA: n välisten vuorovaikutusten tutkimiseen sen toiminnan selvittämiseksi eri organismien genomin olennaisissa prosesseissa.

[TOC]

Ominaisuudet

Tämän tyyppistä proteiinia löytyy kaikista elämän valtakunnista ja vaikka niillä on samat funktionaaliset ominaisuudet, ne ovat rakenteellisesti erilaisia, etenkin niiden konformaatiomuutoksien suhteen, jotka näyttävät olevan spesifisiä jokaiselle SSB -proteiinityypille.

Voi palvella sinua: ABO -järjestelmä: Yhteensopimattomuus, perintö ja todisteet

On havaittu, että kaikilla näillä proteiineilla on säilynyt domeeni, joka on osallisena liitossa yksinkertaisen kaista -DNA: n kanssa ja joka tunnetaan nimellä oligonukleotidi/ oligosakkaridit unionin domeeni (se löytyy bibliografiasta domeenina Ob-A.

Termofiilisten bakteerien SSB -proteiinit, kuten Thermus aquaticus Heillä on merkittäviä ominaisuuksia, koska niillä on kaksi OB -domeenia kussakin alayksikössä, kun taas suurimmalla osalla bakteereista on vain yksi näistä alayksiköissä.

Useimmat SSB. Kunkin SSB: n liitto riippuu sen rakenteesta, osuuskunnan asteesta, oligomerisaatiotasosta ja erilaisista ympäristöolosuhteista.

Kaksiarvoisten magnesiumionien pitoisuus, suolojen pitoisuus, pH, lämpötila, polyamiinien läsnäolo, spermidiini ja siittiöt, ovat joitain tutkituista ympäristöolosuhteista In vitro jotka vaikuttavat eniten SSB -proteiinien aktiivisuuteen.

Rakenne

Bakteereilla on homo-tetrameeriset SSB-proteiinit, ja jokaisella alayksiköllä on yksi OB-liiton hallitseminen. Päinvastoin, virus SSB.

N-terminaalisessa päässä SSB.

Kolme triptofaanitähdettä asemissa 40, 54 ja 88 ovat jäämiä, jotka vastaavat vuorovaikutuksesta DNA: n kanssa unionin domeeneissa. Nämä välittävät paitsi DNA-proteiini-vuorovaikutuksen stabilointia, myös muiden proteiinin alayksiköiden rekrytointia.

SSB -proteiini JA. koli Se on mallinnettu laskennallisissa tutkimuksissa ja on määritetty, että sen tetrameerinen rakenne on 74 kDa ja että se liittyy yksinkertaiseen kaista -DNA: han eri SSB -tyyppisten alayksiköiden yhteistyövuorovaikutuksen ansiosta.

Voi palvella sinua: Punainen fenolista: Ominaisuudet, valmistelu, sovellukset

Archaeasissa on myös SSB -proteiineja. Nämä ovat monomeerisiä ja niillä on vain yksi DNA: n tai domeenin mestaruus.

Eukaryooteissa RPA -proteiinit ovat rakenteellisesti monimutkaisempia: ne koostuvat heterotromeeristä (kolmesta eri alayksiköstä), joka tunnetaan nimellä RPA70, RPA32 ja RPA14.

Heillä on ainakin kuusi oligonukleotidien/oligosakkaridien verkkotunnuksia, vaikka nykyään vain neljä näistä sivustoista tunnetaan tarkasti: kolme RPA70 -alayksikössä ja huone, joka asuu RPA32 -alayksikössä.

Funktiot

SSB -proteiineilla on keskeiset toiminnot genomin ylläpitämisessä, pakkaamisessa ja organisoinnissa suojaamalla ja stabiloimalla yksinkertaisia ​​ketjun DNA -juosteita silloin, kun ne paljastetaan muiden entsyymien vaikutuksella.

On tärkeää pitää mielessä, että nämä proteiinit eivät ole proteiineja, jotka ovat vastuussa DNA -juosteiden purkamisesta ja avaamisesta. Sen toiminta rajoittuu vain DNA: n stabiloimiseksi, kun se on yksinkertaisen kaista -DNA: n kunnossa.

Nämä SSB -proteiinit toimivat yhteistyössä yhteistyössä, koska yhden niistä yhdistys helpottaa muiden proteiinien yhdistymistä (SSB tai ei). DNA -metabolisissa prosesseissa näitä proteiineja pidetään eräänlaisena edelläkävijänä tai primaarisena proteiinina.

Näiden proteiinien liitoksella DNA: ksi on sen primaarinen toiminta, yksinkertaisten ketjun DNA -kaistajen stabiloinnin lisäksi näiden molekyylien suojaaminen tyypin V endonukleaasien hajoamiseen.

SSB -tyyppiset proteiinit osallistuvat aktiivisesti kaikkiin eläviin organismeihin DNA -prosesseihin. Tällaiset proteiinit etenevät replikaatiohaarukan kehittyessä ja pidä kaksi vanhempien DNA -ketjua erillään.

Voi palvella sinua: Haiman lipaasi: rakenne, toiminnot, normaalit arvot

Esimerkit

Bakteereissa SSB -proteiinit stimuloivat ja stabiloivat proteiinitoimintoja. Tämä proteiini on vastuussa DNA: n korjaamisesta (SOS -reaktio) ja rekombinaatioprosessi yksinkertaisten komplementaaristen kaistamolekyylien välillä.

Mutantit JA. koli Geneettisesti manipuloitu viallisten SSB -proteiinien saamiseksi estetään nopeasti, eivätkä ne täytä tehokkaasti niiden toimintoja DNA: n replikaatiossa, korjaamisessa ja rekombinaatiossa.

RPA -tyyppiset proteiinit hallitsevat solusyklin etenemistä eukaryoottisoluissa. Erityisesti uskotaan, että RPA4: n solukonsentraatiolla voi olla epäsuora vaikutus DNA: n replikaation läpäisyyn, ts. RPA4: n korkeissa pitoisuuksissa tämä prosessi estetään.

On ehdotettu, että RPA4: n ekspressio voi estää solujen lisääntymistä estämällä replikaatiota ja sillä on merkitystä terveellisten solujen elinkelpoisuuden ylläpitämisessä ja merkitsemisessä eläinten organismeissa.

Viitteet

1. Anthony, E., & Lohman, T. M. (2019, helmikuu). E: n dynamiikka. Coli yhden juosteen DNA: n sitoutumisproteiini-DNA-kompleksit. Sisään Seminaarit solu- ja kehitysbiologiassa (Vol. 86, s. 102-111). Akateeminen lehdistö.
2. Beernink, h. T., & Morricic, S. W -. (1999). RMPS: Rekombinaatio-/replikaation välittäjäproteiinit. Trendit biokemiallisissa tieteissä, 24(10), 385-389.
3. Bianco, P. R -. (2017). SSB: n tarina. Biofysiikan ja molekyylibiologian edistyminen, 127, 111-118.
4. Byrne, b. M., & Oakley, G. G. (2018, marraskuu). Proteiini A replikaatio, laksatiivi, joka pitää DNA: n säännöllisenä: RPA -fosforylaation merkitys genomin stabiilisuuden ylläpitämisessä. Sisään Seminaarit solu- ja kehitysbiologiassa. Akateeminen lehdistö
5. Krebs, J. JA., Goldstein, E. S., & Kilpatrick, S. T. (2017). Lewinin geenit xii. Jones & Bartlett Learning.
6. Lecointe, f., Serena, c., Velten, m., Kustannukset, a., McGovern, S., Meile, J. C.,… & Pollard, P. (2007). Kromosomaalisen replikaatiohaarukan pidätys. EMBO -lehti, 26(19), 4239-4251.